एनएसकेएफडीसी की योजनाओं/कार्यक्रमों का क्रियान्वयन राज्य माध्यम अभिकरणों (एस.सी.एज.) जोकि राज्य सरकारों/संघ शासित प्रशासनों द्वारा नामित हैं के माध्यम से एवं क्षेत्रीय ग्रामीण बैंकों (आर.आर.बी.) एवं राष्ट्रीयकृत बैंकों के माध्यम से करता है।  
एस.सी.एज/आर.आर.बी./राष्ट्रीयकृत बैंकों द्वारा एनएसकेएफडीसी के लक्षित समूह को रियायती ब्याज दरों पर किसी भी आय अर्जित करने वाली गतिविधि जिसमें स्वच्छता गतिविधयाॅ भी सम्मिलित हैं, के लिए राशि वितरित की जाती है।
एनएसकेएफडीसी द्वारा सफाई कर्मचारियों, स्वच्छकारों एवं उनके आश्रितों के सामाजिक एवं आर्थिक उत्थान हेतु चलाई जा रही विभिन्न ऋण एवं गैर ऋण आधारित योजनाओ का विस्तृत विवरण के लिए योजना और कार्यक्रम देखें I